Objava v priznani reviji Science of The Total Environment (IF 9,8, Q1/A'') je zelo pomembna, saj kot prva predstavi metataksonomsko analizo regije 16S V3–4 mikrobnih združb na mikroplastiki iz školjk v Sloveniji in svetu. Izr. prof. dr. Anja Klančnik je pojasnila: »Področje mikroplastike v živilih se v Sloveniji šele razvija, saj standardiziranih metod za izolacijo mikroplastike iz živilskih matriksov še nimamo. Publikacija je nastala v okviru projekta J4-4548, na katerem naša raziskovalna skupina dela zadnji dve leti, in je pomembno prispevala k vzpostavitvi ustrezne metodologije za analizo mikrobnih združb na površini mikroplastike iz hrane in vode. Postavila je tudi temelje za nadaljevanje projekta, ki preučuje vlogo mikroplastike pri zagotavljanju novih in mobilnih površin za naseljevanje in prenos biofilmov v proizvodni verigi živil.«
Slika 1: Shema metodologije s štirimi glavnimi koraki: vzorčenje vode in školjk, izolacija mikroplastike, izolacija in sekvenciranje DNA z delcev mikroplastike ter določitev kemijske sestave mikroplastike.
Objava predstavlja uspešno slovensko sodelovanje z dr. Manco Kovač Viršek, ki je izvedla vzorčenje obalne morske vode in sredozemskih školjk na školjčni farmi pri Debelem rtiču. Na Biotehniški fakulteti UL so nato iz morskega vodnega stolpca izolirali 12,7 delcev mikroplastike /m³ morske vode in 0,58 delca /posamezno školjko. Z mednarodnim sodelovanjem z dr. Nicol Janecko s Quadram Institute Bioscience, Združeno kraljestvo, so iz mikroplastike, izoliranih iz morske vode in školjk, izolirali celotno DNA, pripravili knjižnico DNA in sekvencirali regijo 16S V3-V4.
V objavi so avtorji izpostavili, da mikroplastika v okolju hrane deluje kot zbiralnik mikrobnih združb. Med pridobljenimi trdnimi delci iz morske vode in klapavic so z vizualno analizo poiskali delce mikroplastike in jih razporedili glede na morfološki razred, velikost, barvo in prosojnost. S spektrometrijo ATR-FTIR so določili kemijsko sestavo ter ugotovili, da med delci mikroplastike v vzorcih morske vode prevladujejo fragmenti polivinilklorida (PVC), v vzorcih školjk pa so prevladovala najlonska vlakna in fragmenti polietilena (PE). Prva avtorica Živa Kolenc je poudarila: »Z metataksonomsko analizo smo na mikroplastiki iz školjk in vode identificirali več rodov bakterij. Določili smo prevladujočo prisotnost rodu Pseudomonas, nekaj morskih rodov, v manjših deležih pa tudi nekatere rodove, ki vsebujejo potencialno patogene vrste, kot sta Serratia in Campylobacter.«
Slika 2: Živa Kolenc pri raziskovalnem delu.
To delo bilo podprto s sredstvi ARIS v okviru projektov J4-4548 ter P4-0116, Ministrstva za kmetijstvo, gozdarstvo in prehrano ter ARIS v okviru projekta V1-2205 in Ministrstva za naravne vire in prostor, ter s sredstvi Sveta za biotehnologijo in biološke znanosti (BBSRC, Biotechnology and Biological Sciences Research Council, BB/X011011/1) v okviru proejktov BBS/E/F/000PR13634, BBS/E/F/000PR13635 ter BBS/E/F/000PR13636.
Povzetek znanstvenega članka je dostopen na https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S004896972405280X
Slika 3: Mikroplastika, s katere smo uspešno izolirali in sekvencirali DNA.
Izpisek iz SICRIS – JUG, Blaž, ŠIKIĆ POGAČAR, Maja, STERNIŠA, Meta, TUMPEJ, Tadeja, KARNIČAR, KOLENC, Živa, KOVAČ VIRŠEK, Manca, KLANČNIK, Anja, JANECKO, Nicol. Microbial communities on microplastics from seawater and mussels: Insights from the northern Adriatic Sea. Science of the total environment. Nov. 2024, vol. 949, [article no.] 175130, str. 1-7, ilustr. ISSN 0048-9697. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S004896972405280X?via%3Dihub, Repozitorij Univerze v Ljubljani – RUL, DOI: 10.1016/j.scitotenv.2024.175130. [COBISS.SI-ID 204455171]
Objavljeni povzetek znanstvenega prispevka na konferenci - povezani s raziskovalnim področjem članka
KOLENC, Živa, KOVAČ VIRŠEK, Manca, JANECKO, Nicol, KLANČNIK, Anja. Prenos mikrobnih združb z mikroplastiko: vzorci s slovenske obale. V: KUŠAR, Darja (ur.), JAMNIKAR CIGLENEČKI, Urška (ur.). 9. kongres Slovenskega mikrobiološkega društva : knjiga povzetkov : 14.–16. februar 2024. Ljubljana: Slovensko mikrobiološko društvo, 2024. Str. 123. ISBN 978-961-96562-0-4. https://smd2024.si/wp-content/uploads/2024/02/2024-02-12-knjiga-povzetkov-SMD_Compress.pdf. [COBISS.SI-ID 185890051] kategorija: SU (S)
KOLENC, Živa, KOVAČ VIRŠEK, Manca, KLANČNIK, Anja, JANECKO, Nicol. Microbial communities on microplastics from nearshore seawater and Mediterranean mussels Mytilus galloprovincialis in Slovenia. V: OGRINC, Nives (ur.), et al. 2nd ISO-FOOD Symposium From Food Source to Health : book of abstracts : Portorož, Slovenia, April 24-26, 2023. 1st ed. Ljubljana: Jožef Stefan Institute, 2023. Str. 79, ilustr. ISBN 978-961-264-268-6. [COBISS.SI-ID 150783235] kategorija: SU (S) točke: 0.5, št. avtorjev: 4
KOLENC, Živa, KLANČNIK, Anja. Efficiency of DNA extraction kits for microplastic-associated biofilms. V: STOPNIŠEK, Nejc (ur.). Slovenian Microbiome Network Symposium 2023 : Defining a healthy microbiome : 30. 11. - 1. 12. 2023, Maribor, Slovenia : abstract book. Maribor: Nacionalni laboratorij za zdravje, okolje in hrano, 2023. Str. 56-57, p6. ISBN 978-961-6148-23-8. https://doi.org/10.5281/zenodo.10214965. [COBISS.SI-ID 174405891] kategorija: SU (S)